دوربین کانن Canon EOS M6 Mark II از شباهت های بسیاری زیادی با مدل های پیش از خود برخوردار است اما در هر صورت ساختار بدنه و کنترل های آن دچار تغییراتی نیز شده است .
وجود دو دایل کنترل بر روی قسمت فوقانی بدنه به همراه یک دکمه مخصوص کنترل جبران نوردهی ، از ویژگی های این دوربین به شمار آورده می شوند. در قسمت مرکزی دایل پشتی دوربین گزینه 'Dial Func' برای انتخاب عملکرد ها و یا جا به جا شدن بین تنظیمات دوربین ؛ قرار داده شده است .
همچنین در قسمت پشتی بدنه این دوربین یک سدوئیچ MF/AF برای تغییر وضعیت فوکوس دوربین از حالت خودکار به دستی ؛ قرار داده شده است .